Fin dall'epoca del normanno Tancredi fu territorio feudale, appartenendo dapprima a Niccolò Amendolia e successivamente, nel 1384, ad Orso Minutolo, i cui eredi ne mantennero a lungo il possesso sino all'inizio del XVIII secolo.

Nel 1723 il feudo venne incorporato nel Marchesato di Taviano appartenente ai Caracciolo. Nel 1816 Melissano divenne frazione del Comune di Casarno, finchè, nel 1921, ottenuta l'autonomia amministrativa, divenne Comune indipendente.

Il centro conservava, sino a qualche anno addietro, alcuni ruderi del castello degli Amendolia e poi dei Caracciolo, successivamente demoliti per far luogo a nuovi edifici.

L'attuale Chiesa Parrocchiale, dedicata a Maria SS. del Rosario e a Sant'Antonio da Padova, è stata costruita su di un corpo più antico risalente al XVII secolo.